虽然胎儿超声波检查中中期精密超声波检查最为重要，但最近为了尽快诊断胎儿是否畸形，妊娠初期会进行透明带检查。妊娠11-13周会检查到胎儿颈部后透明部位的厚度与形状，透明带较厚，内部有结膜的情况为危险度增加。此检查还可早期预测出康氏综合症等染色体异常或心脏畸形等重要畸形可能性，异常时尽早，迅速为事后做准备。
为了精密观察胎儿，妊娠20周-30周为最佳时期。这个时期是明显可看出胎儿的时期，20周以前胎儿的器官还太小或者未成熟，30周以后胎儿太大，紧夹在子宫，很难观察到胎儿的轮廓。一般超声波检查所有孕妇在门诊诊疗室进行，诊断的准确度为40-50%左右。门诊超声波检查主要观察胎儿的大小，位置，胎儿的心跳等，时间有限或者超声波像素的关系会对胎儿畸形诊断有阻碍。
对比精密超声波检查(level Ⅱ)使用像素高的超声笔机器，有充分的时间检查，诊断率可提高为80-90%。精密超声波检查的最佳时期为20-24周期间，除了一般超声波确认的事项外，还精密检查胎儿的外形，胎儿的大脑，包括心脏等内部器官。尤其是对心脏等主要血管进行多普勒检查，精密检查血液流淌是否有异常，为发现康舒综合症，不仅有主要所见，甚至为确认胎儿小拇指的关节数而做出努力。 原本意图是为高危险产妇群（满35岁以上孕妇，畸形儿检查中有异常的孕妇，妊娠初期接触药物或者化学物品的产妇，有过产畸形儿经历的产妇，糖尿病产妇，在其他医院诊断为胎儿有异常的产妇，一般超声波检查中发现异常的产妇等）检查，最近不是高危险产妇群，一般也实行准确度较高的精密超声波检查。
妊娠27-29周实行。考虑到胎儿的大小，羊水量还有胎儿的动态，这个时期可捕捉到最美丽的立体胎儿照片。四维超声波可通过视频看到在孕妇腹部内动的胎儿。妈妈爸爸对胎儿会有更弄的亲近感。不仅可确认胎儿的外部形态，还可在妊辰中期进行精密超声波检查后可发生的内部畸形有追加确认。 特殊超声波检查后发现异常后，会按照畸形种类和情况实行短期追踪检查，是否需要血液检查或羊水检查，或者是否需要胎儿治疗 等事后方向。
但精密检查不是可检查出所有的胎儿畸形，因为超声笔机器本身有限制，有可能会有超声波检查困难或者根本检查不出的畸形，还有有些畸形妊娠末期才会出现。许多肿瘤会在妊娠末期出现，小便流出的长度，肠，肺动脉 等现象也会在妊娠末期渐渐进行并出现。